Ізаак Цилков був сином талмудиста Мойсея Арона Цилкова з Бєжуня. Він виріс в асиміляторсько-реформістському середовищі варшавської рабинської школи, яку закінчив у 1859 році. Потім рік вивчав медицину, але перервав навчання і завдяки стипендії асоціації Ломдей-Тора поїхав до Берліна для поглиблених філософсько-теологічних студій. Він отримав ступінь доктора філософії та семітської філології в університеті Галле. Після Січневого повстання повернувся до Польщі. У 1865 році став проповідником у синагозі на вулиці Даниловичівській, де виголошував проповіді польською мовою. Він став першим рабином Великої синагоги в Тломацькому, де виступив на церемонії її відкриття в 1878 році, закликаючи до взаєморозуміння і толерантності між релігіями. Ця промова, виголошена польською мовою, всупереч розпорядженням російської влади, стала переломним моментом у громадському житті євреїв-реформаторів Варшави. Понад 30 років він перекладав єврейські книги зі Старого Завіту на польську мову. Перший переклад Псалтиря з'явився в 1883 році. У 1895 році Тора (тобто так зване П'ятикнижжя, перші п'ять книг Старого Заповіту) вийшла двома виданнями (з коментарями і без). Потім, у перші роки 20-го століття, були опубліковані нові книги. Ця робота вважається першим перекладом Старого Завіту, заснованим переважно на єврейській версії.